Dans son rapport 2009, le Haut Conseil analyse l’état des comptes, la prise en charge des dépenses de soins par les différents financeurs et la « maîtrise médicalisée » de la dépense de santé (comment concilier la qualité des soins et le respect des contraintes financières ?).
Dans ce rapport, figurent également les avis sur le médicament et la situation des établissements de santé adoptés depuis le rapport précédent.